Exposición permanente
Zoología
Se muestran ejemplares de diferentes partes del mundo, pertenecientes a las colecciones históricas del museo.
Constituida por ejemplares, conservados en seco o en alcohol, de animales que viven en el medio marino, procedentes de colecciones históricas y actuales.
Se expone una representación de la fauna terrestre gallega, destacando los dioramas en los que diferentes especies de aves y mamíferos se muestran en un escenario que representa su hábitat y modo de vida en la naturaleza.
En esta sección se guarda uno de los mayores tesoros del patrimonio científico de la Universidad de Santiago de Compostela, la colección de modelos cristalográficos de Haüy.
Las colecciones de minerales y rocas y los mapas que se exponen son un ejemplo de la generosidad de los naturalistas gallegos hacia la Universidad de Santiago, destacando las donadas por Isidro Parga Pondal y la colección Viqueira.

Se muestran una selección de ejemplares de colecciones históricas, principalmente americanas y gallegas, además de figuras clásticas empleadas con fines didácticos.
Instrumental científico
Instrumental científico vario de los siglos XIX y XX usado en los laboratorios y en el trabajo de campo en la ámbito de la Biología.
Colección de modelos utilizados con fines didácticos en el Gabinete.