P2012214 - Técnicas de Neurobioloxía Molecular (Módulo Neurobioloxía Celular e Molecular) - Curso 2013/2014

Información

• Créditos ECTS
• Créditos ECTS: 3.00
• Total: 3.0
• Horas ECTS
• Clase Expositiva: 5.00
• Clase Interactiva Laboratorio: 21.00
• Clase Interactiva Seminario: 1.00
• Horas de Titorías: 3.00
• Total: 30.0

Outros Datos

• Tipo: Materia Ordinaria Máster RD 1393/2007
• Departamentos: Bioloxía Celular e Ecoloxía, Departamento Externo
• Áreas: Bioloxía Celular, Área Externa para o postgrao oficial
• Centro: Facultade de Bioloxía
• Convocatoria: 2º Semestre de Titulacións de Grao/Máster
• Docencia e Matrícula: null

Profesores

Nome	Coordinador
CANDAL SUAREZ, EVA MARIA.	NON

Horarios

Nome	Tipo Grupo	Tipo Docencia	Horario Clase	Horario exames
Grupo /CLE_01	Ordinario	Clase Expositiva	NON	NON
Grupo /CLIL_01	Ordinario	Clase Interactiva Laboratorio	NON	NON
Grupo /CLIS_01	Ordinario	Clase Interactiva Seminario	NON	NON
Grupo /TI-ECTS01	Ordinario	Horas de Titorías	NON	NON

Programa

Existen programas da materia para os seguintes idiomas:

Castelán

Galego

Inglés

Obxectivos da materia
-Coñecer as técnicas de laboratorio e recursos bioinformáticos empregados actualmente en neurobioloxía molecular.
-Desenvolver habilidades para a utilización destas técnicas de modo práctico.
-Exercitarse no manexo de bibliografía especializada e na lectura crítica de artículos científicos que empreguen técnicas de neurobioloxía molecular.

Contidos
PROGRAMA DE CLASES TEÓRICAS. Cada grupo asistirá ás seguintes clases teóricas (3 horas)

Tema 1: Bases da Bioloxía Molecular. Conceptos básicos sobre os fundamentos das prácticas a realizar.

Tema 2: Xenes marcadores do proceso de diferenciación neuronal. Análisis da expresión de xenes mediante ribosondas.

Tema 3: Cómo determinar a función dun xene (I). Sobreeexpresion de xenes in vivo: transxénese, transfección, inxección de ARNm.

Tema 4: Cómo determinar a función dun xene (II). Silenciación de xenes in vitro e in vivo: morpholinos, siRNA.


PROGRAMA DE CLASES PRÁCTICAS (laboratorio e bioinformática). Cada grupo realizará as seguintes prácticas, de luns a venres.

Práctica 1. Extracción do ARN total de cerebelo e obtención do ADNc (6 horas).

Práctica 2. Bioinformática: busca de secuencias conservadas nas bases de datos e uso de software xenético para o diseño de cebadores. Illamento e purificación de xenes mediante PCR (5 horas).

Práctica 3. Clonación dun xene de diferenciación nun vector (ligación en vector e transformción en células competentes). Obtención de preparacións de ADN plasmídico (6 horas).

Práctica 4. Obtención de ribosondas antisentido para detección de ARN mediante hibridación in situ: linearización de ADN plasmídico, purificación do ADN lineal, transcrición e purificación de ribosondas (7 horas).

Bibliografía básica e complementaria
Bibliografía

Tema 1:
- Morel G, Cavalier A, Caballero TG, Gallego R. 2000. Hibridación in situ en microscopía óptica. Santiago de Compostela: Universidade, Servicio de Publicacións.
- Sambrook J, Russell DW. 2001. Molecular cloning. A laboratory manual. 3rd ed. New York, Cold spring Harbor Laboratory Press.
- Turner PC, McLennan AG, Bates AD, White MRH. 2001. Molecular Biology. 2nd ed. Oxford. BIOS Scientific Publishers Ltd.

Tema 2:
- Perron M, Kanekar S, Vetter ML, Harris WA. 1998. Dev Biol. The genetic sequence of retinal development in the ciliary margin of the Xenopus eye. 199:185-200.
- Deyts C, Candal E, Joly JS, Bourrat F. 2005. An automated in situ hybridization screen in the Medaka to identify unknown neural genes. Dev Dyn. 234:698-708.
- Quiring R, Wittbrodt B, Henrich T, Ramialison M, Burgtorf C, Lehrach H, Wittbrodt J. 2004. Large-scale expression screening by automated whole-mount in situ hybridization.Mech Dev. 121:971-6.

Tema 3:
- Ando H, Okamoto H. 2006. Efficient transfection strategy for the spatiotemporal control of gene expression in zebrafish. Mar Biotechnol (NY). 8:295-303.
- Candal E, Alunni A, Thermes V, Jamen F, Joly JS, Bourrat F. 2007. Ol-insm1b, a SNAG family transcription factor involved in cell cycle arrest during medaka development. Dev Biol. in press.
- Ohnuma S, Mann F, Boy S, Perron M, Harris WA. 2002. Lipofection strategy for the study of Xenopus retinal development. Methods. 28:411-9.
- Ogino H, McConnell WB, Grainger RM. 2006. Highly efficient transgenesis in Xenopus tropicalis using I-SceI meganuclease. Mech Dev. 123:103-13.
- Thermes V, Grabher C, Ristoratore F, Bourrat F, Choulika A, Wittbrodt J, Joly JS. 2002. I-SceI meganuclease mediates highly efficient transgenesis in fish. Mech Dev. 118:91-8.
- Altafaj X, Joux N, Ronjat M, De Waard M. 2006. Oocyte expression with injection of purified T7 RNA polymerase. Methods Mol Biol. 322:55-67.

Tema 4:
- Fountaine TM, Wood MJ, Wade-Martins R. 2005. Delivering RNA interference to the mammalian brain. Curr Gene Ther. 5:399-410.
- Heasman J. 2002. Morpholino oligos: making sense of antisense? Dev Biol. 243:209-14.
- Summerton JE. 2007. Morpholino, siRNA, and S-DNA compared: impact of structure and mechanism of action on off-target effects and sequence specificity. Curr Top Med Chem.7:651-60.

Competencias
O alumno deberá posuir e potenciar as siguientes competencias e destrezas xenéricas:
- Compromiso persoal de esforzo para a aprendizaxe.
- Capacidade de análisise e síntesise.
- Habilidades para conseguir analizar información dende diferentes fontes.
- Capacidade para aplicar a teoría á práctica.
- Habilidade para traballar de forma autónoma e en equipo.

Metodoloxía da ensinanza
Os alumnos serán divididos en grupos de 10 para a realización do curso. Utilizaránse:
- Clases de introducción sobre os fundamentos teóricos.
- Prácticas de laboratorio.

Sistema de evaluación
- A asistencia e participación nas clases teóricas terase en conta e representará o 10% da nota final.
- A asistencia e participación nas prácticas é obligatoria e necesaria para a superación das mesmas. Representará un 20% da nota final.
- O alumno deberá superar un exame que representará o 70% sobre a nota final

Tempo de estudo e traballo persoal
3 créditos ECTS (1ECTS = 27 horas de traballo presencial ou non presencial). Total: 81 horas, que se reparten da seguinte forma:

30 horas presenciais:

- Fundamentos teóricos acerca de temas relacionados coas actividades prácticas propostas: 3 horas.

- Desenvolvemento no laboratorio das actividades prácticas propostas: 24 horas.

- Realización do exame: 3 horas

51 horas non presenciais (de traballo do alumno):

- Traballo persoal de estudo e consulta do material bibliográfico e información obtida durante o desenvolvemento das actividades: 35 horas.

- Traballo persoal de práctica das ferramentas bioinformáticas utilizadas no curso: 15 horas.

- Tutorías personalizadas: 1 hora.

Recomendacións para o estudo da materia
- Asistencia e participación activa nas actividades programadas.
- Estudo e consulta do material bibliográfico e da información obtida durante o desenvolvemento das actividades.
- Aclaración cos profesores de posibles dúbidas.

Observacións
Material necesario que debe traer o alumno
Bata de laboratorio, calculadora, caderno para anotacións.