P2062104 - Bioinformática (Materias Obrigatorias) - Curso 2013/2014

Información

• Créditos ECTS
• Créditos ECTS: 3.00
• Total: 3.0
• Horas ECTS
• Clase Expositiva: 9.00
• Clase Interactiva Seminario: 12.00
• Horas de Titorías: 3.00
• Total: 24.0

Outros Datos

• Tipo: Materia Ordinaria Máster RD 1393/2007
• Departamentos: Matemática Aplicada, Xeometría e Topoloxía
• Áreas: Matemática Aplicada, Xeometría e Topoloxía
• Centro: Facultade de Medicina e Odontoloxía
• Convocatoria: 1º Semestre de Titulacións de Grao/Máster
• Docencia e Matrícula: Primeiro Curso (1º 1ª vez)

Profesores

Nome	Coordinador
ALVAREZ DIOS, JOSE ANTONIO.	NON
GOMEZ TATO, ANTONIO.	SI

Horarios

Nome	Tipo Grupo	Tipo Docencia	Horario Clase	Horario exames
Grupo /CLE_01	Ordinario	Clase Expositiva	SI	NON
Grupo /CLIS_01	Ordinario	Clase Interactiva Seminario	SI	NON
Grupo /TI-ECTS01	Ordinario	Horas de Titorías	NON	NON
Grupo /TI-ECTS02	Ordinario	Horas de Titorías	NON	NON

Programa

Existen programas da materia para os seguintes idiomas:

Castelán

Galego

Inglés

Obxectivos da materia
Introducir ao alumno no manexo de ferramentas bioinformáticas, en particular algunhas das que se usarán nas diferentes materias do master.

Contidos
1. Bases de datos bioinformáticos e as ferramentas de procura.
Bases de datos genómicas. Aliñamento de dúas secuencias. Procura rápida de similaridad.
Software: FASTA, BLAST

2. Aliñamento de secuencias e filogenia.
Aliñamento múltiple de secuencias. Filogenia a partir dunha matriz de distancias.
Software: CLUSTAL

3. Análise de genomas

4. Bases de datos GO e KEGG.

Bibliografía básica e complementaria
Deonier, R. C., Tavaré, S. & Waterman, M. S., Computational Genome Analysis, An introducction, Springer, 2005, USA
Salemi, M. & Vandamme A. (Ed.) The Phylogenetic Handbook, Cambridge University Press, 2003, UK.
Stekel, Dov, Microarray Bioinformatics, Cambridge University Press, 2003, UK.

Competencias
En particular, o alumno ao finalizar o curso saberá:
1. Utilizar BLAST para procura de secuencias en bases de datos, aliñalas con CLUSTAL e (no seu caso) facer unha análise filogenético das mesmas.
2. Utilizar as bases de datos GO e KEGG para facer anotación funcional.

Metodoloxía da ensinanza
Aínda que a metodoloxía docente será eminentemente práctica, buscarase a comprensión por parte do alumno dos métodos matemáticos e estatísticos utilizados en cada unha das distintas ferramentas.

Sistema de evaluación
Realización e presentación dun traballo que implique o uso das ferramentas bioinformáticas estudadas.

Tempo de estudo e traballo persoal
tres horas semanais